clic-clic

Pliage à la maison

Depuis plusieurs années l'université de Stanford a lancé un programme de modélisation sur l'une des protéines impliquées dans les mécanismes du cancer : la p53. Ce programme de modélisation a pour but de comprendre l'architecture dynamique de cette protéine, et la façon dont elle s'auto-assemble et dont elle peut s'associer avec d'autres molécules. Le but étant de pouvoir construire des molécules s'adaptant sur la p53 pour en altérer le fonctionnement avec un résultat thérapeutique. L'originalité du programme très demandeur en ressource informatique est d'avoir été distribué au travers du site Folding@Home sous forme d'un économiseur d'écran connecté à internet. Ainsi tout un chacun a pu télécharger le programme de modélisation, qui s'active quand le PC passe en veille et effectue un petit bout des énormes calculs mis en jeu. Une fois ce bout terminé il envoie le résultat à Stanford et entame un autre bout de processus. Pour rendre la chose ludique, le site collecteur des calculs a un hit-parade des meilleurs contributeurs, qui d'ailleurs peuvent se regrouper en équipes pour mutualiser leur score.

Le 17 novembre a été publié le premier résultat scientifique significatif abouti grâce à ce fonctionnement. Ce résultat n'a encore aucune portée thérapeutique, mais donne une vraie base de travail dans cette direction. Cela est d'autant plus intéressant que le système est maintenant bien rôdé au travers de nombreux autres "pliages".

Les projets d'informatique distribuée de ce type sont réellement nombreux et représentent un très élégant paradigme d'utilisation des ressources informatiques globalisées... Je rappelle aussi que l'un des premiers centre de recherche à avoir lancé cela est le SETI de Berkeley, cher à tous les geeks que nous sommes.

posted by tiberix at 10:03 AM